Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Fndc4Q3TR08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fndc4Q3TR08 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fndc4Q3TR08 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fndc4Q3TR08 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fndc4Q3TR08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fndc4Q3TR08 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms