Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms