Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc13Q3TIR1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms