Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3TEI4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3TEI4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms