Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem104Q3TB48 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem104Q3TB48 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms