Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd8Q3TA59 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms