Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms