Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prr27Q3SYJ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms