Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hddc2Q3SXD3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hddc2Q3SXD3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms