Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccbe1Q3MI99 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms