Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Treml4Q3LRV9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Treml4Q3LRV9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms