Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trpm1Q2TV84 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms