Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sap25Q1EHW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sap25Q1EHW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms