Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q149G0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q149G0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q149G0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q149G0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q149G0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q149G0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q149G0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q149G0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q149G0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q149G0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q149G0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q149G0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q149G0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms