Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd2Q149F1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd2Q149F1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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