Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rundc1Q0VDN7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms