Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd2Q0VBL1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms