Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb8Q0VBD0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms