Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spata18Q0P557 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms