Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnnm1Q0GA42 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms