Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
1700061G19RikQ08EE8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms