Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb2Q08331 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms