Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tgm3Q08189 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms