Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CbfbQ08024 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms