Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou6f1Q07916 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou6f1Q07916 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms