Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MestQ07646 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
MestQ07646 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MestQ07646 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MestQ07646 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MestQ07646 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MestQ07646 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MestQ07646 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms