Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col17a1Q07563 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms