Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AmbpQ07456 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms