Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gdf3Q07104 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms