Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SrstQ06666 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrstQ06666 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms