Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r236Q05A06 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms