Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprgQ05909 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms