Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs3Q05895 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms