Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nf1Q04690 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nf1Q04690 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nf1Q04690 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nf1Q04690 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nf1Q04690 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nf1Q04690 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nf1Q04690 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nf1Q04690 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nf1Q04690 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms