Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smpd1Q04519 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms