Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kcnb1Q03717 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kcnb1Q03717 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms