Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Epha4Q03137 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Epha4Q03137 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms