Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mmp11Q02853 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms