Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1sQ02789 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms