Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlh1Q02576 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlh1Q02576 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms