Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnnb1Q02248 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnb1Q02248 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms