Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd1Q02242 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcd1Q02242 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms