Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snai1Q02085 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snai1Q02085 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms