Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ascl1Q02067 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms