Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VcpQ01853 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VcpQ01853 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms