Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna1cQ01815 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna1cQ01815 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms