Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HmgcrQ01237 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HmgcrQ01237 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms