Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gja5Q01231 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gja5Q01231 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms