Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col1a2Q01149 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms