Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col8a1Q00780 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col8a1Q00780 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms